La Fraternité Saint Thomas Becket organise régulièrement des retraites spirituelles à l'école de saint Ignace de Loyola et des saints de France. Les retraites sont ouvertes aux enfants (à partir de 8 ans), aux adolescents et aux adultes.
« Que l’école des Exercices Spirituels soit toujours un remède efficace au mal de l’homme moderne entraîné par le tourbillon des affaires humaines à vivre hors de lui-même, trop pris par les choses extérieures. Qu’ils constituent la formation d’hommes nouveaux, d’authentiques chrétiens, d’apôtres engagés. »
L'œuvre des retraites d'adultes est sous la protection de Saint Louis, celle des retraites pour enfants et adolescents sous la protection de Saint Dominique Savio.
